Poleg zaporne kazni je Črnigoju sodišče odredilo tudi plačilo 1,4 milijona evrov odškodnine Primorju v stečaju. Na novogoriškem sodišču je sodnik Goran Klavora po letu dni obravnav torej izrekel sodbo za primer, star 12 let. Gre za preprodajo delnic koprskega Stavbenika, ki se je dogajala leta 2001. Obtožnica je Črnigoju očitala zlorabo položaja zaradi prodaje 95.305 delnic Stavbenika. Prodal jih je družbi Vital in s tem naj bi po obtožnici oškodoval Primorje za skoraj poldrugi milijon evrov. Delnice naj bi prodal pod ceno.

Tožilka: "44 mesecev zapora"
Višja državna tožilka Damijana Bandelj je na petkovi sklepni obravnavi poudarila, da "gre za klasično tajkunsko zgodbo". Za Črnigoja je pričakovala tri leta in osem mesecev zaporne kazni ter plačilo 25.000 evrov in stroškov postopka. Sodna pooblaščenka Primorja Sabina Mikulin je v imenu Primorja v stečaju zahtevala še plačilo 1,4 milijona evrov, za kolikor naj bi domnevno Črnigoj kot odgovorni v tem primeru skupaj s sodelavci oškodoval podjetje, ki ga je tedaj vodil.

Črnigoj: "Delal sem zakonito!"
Črnigojeva odvetnika Janez Košak in Danilo Grilj pa predlagata oprostilno sodbo, saj po njunem mnenju krivda ni bila dokazana. Trdita, da delnice niso bile prodane pod tržno vrednostjo – kar je potrdila tudi večina sodnih izvedencev v postopku. Poštena vrednost delnic naj bi se gibala med 1.791 in 2.190 takratnimi tolarji, prvi mož Primorja pa jih je prodal po 1.825 tolarjev, torej še znotraj razpona tako imenovane poštene vrednosti, je na eni izmed obravnav razlagal sodni izvedenec Branko Mayer.

Črnigoj je sodno zgodbo glede preprodaje delnic Stavbenika na zaključnem zagovoru komentiral: "Takrat sem pomagal Stavbeniku, ki se je znašel v težavah, Primorju pa sem s to transakcijo izboljšal likvidnostni položaj. Delal sem zakonito. Pripojitev Stavbenika k Primorju je bila takrat nujna za obe družbi."

Črnigoj – upokojenec in zapornik
Črnigoja so po izreku sodbe z novogoriškega sodišča odpeljali v koprski zapor. Tam že prestaja 14-mesečno zaporno kazen iz zadeve Čista lopata, kjer skrbi za tamkajšnjo zaporniško knjižnico. Sicer pa je nekdanji prvi mož Primorja in zagotovo – poleg Zidarja – najbolj razvpiti "gradbeni baron" zdaj upokojenec. Na novogoriški obravnavi je dejal, da ima 1.500 evrov pokojnine. Malce čudna številka, če vemo, da je bil Dušan Črnigoj dolga leta med najbolj plačanimi menedžerji v Slovenji.

Leta 2008 je bil celo prvi na lestvici sto najbolje plačanih direktorjev – prejemal je 64.700 evrov bruto na mesec, kar je bilo 44-krat več kot povprečno zaposleni v Primorju. Ali še drugače – v celotnem letu 2008 je dobil kar 776.400 evrov. Leto pozneje se je ta številka prepolovila. Na lestvici najbolj plačanih menedžerjev je Dušan Črnigoj padel na 14. mesto, še vedno pa je prejel vrtoglavo plačilo: 355.248 evrov!