Za direktorja IJS-ja je lahko imenovan raziskovalec z izobrazbo s področja dejavnosti instituta, ki ustreza ravni izobrazbe, pridobljene po študijskih programih tretje stopnje in je v skladu zakonom o slovenskem ogrodju kvalifikacij uvrščena na deseto raven.

Med pogoji so še izkušnje pri opravljanju zahtevnejših vodstvenih nalog, sposobnosti za organiziranje in vodenje znanstvenoraziskovalnega dela ter izpolnjevanje kriterijev za vodjo temeljnega raziskovalnega projekta, je razvidno iz razpisa, objavljenega na spletnih straneh inštituta in v časniku Delo.

Kandidati morajo pripraviti tudi vizijo razvoja instituta za pet let, ki jo bodo predstavili na skupni seji upravnega odbora in znanstvenega sveta IJS-ja. Direktorja IJS-ja imenuje in razrešuje upravni odbor s soglasjem vlade.

Zalar je položaj direktorja IJS-ja nastopil 1. decembra 2020, pred njim je od leta 2005 inštitut vodil Jadran Lenarčič.

IJS je bil ustanovljen leta 1949 in se ponaša z bogato tradicijo temeljnih in aplikativnih raziskav na področju naravoslovja in tehnike. Njegovo poslanstvo je s sodobnimi raziskovalnimi metodami in vrhunskim znanjem reševati pereče težave sodobnega časa in prispevati k napredku družbe.