Le nekaj mesecev po tem, ko je Gillian priznala, da je bila intimna s številnimi ženskami, je v javnost prišla novica, da se razhaja s svojim dolgoletnim partnerjem. Nekdaj rdečelaska, ki je v seriji Dosjeji X igrala agentko Dano Scully, je bila z Markom v zvezi od leta 2006. Par ima skupaj dva otroka, petletnega Oskarja in triletnega Felixa.

Novico je za medije že potrdil igralkin predstavnik za odnose z javnostmi: "Gillian Anderson in njen partner Mark Griffiths sta se po šestih letih prijateljsko razšla."

Za 44-letnico je to že tretja neuspešna resna zveza. Prvič je bila poročena z direktorjem fotografije Clydom Kotzom, s katerim ima tudi 17-letno hčer Piper, drugič pa je v zakonski jarem skočila z ustvarjalcem dokumentarnih filmov Julianom Ozannom. Še pred obema zakonoma pa so jo privlačile predvsem ženske.

Za priljubljeno homoseksualno revijo je marca izdala, da je z dekleti začela eksperimentirati, ko je prišla iz Londona v Združene države, in dodala: "Ko sem bila v srednji šoli, sem bila dolgo v zvezi z dekletom." Ni pa znano, ali so te izjave vplivale na njeno razmerje z Markom.