Dušan Črnigoj in Alojz Bolčina sta bila skupaj s Hrvatom Mariem Gvozdenom obtožena, da sta leta 2006 zlorabila položaj ob nakupu bosansko-hercegovskega podjetja Miljkovići oziroma kamnoloma Mokri Do. Podjetje Miljkovići je bilo namreč brez sredstev in prezadolženo ter ni imelo koncesije za izkoriščanje kamnoloma, zato je bilo po mnenju tožilstva brez kakršne koli tržne vrednosti.

Po navedbah tožilstva naj bi Črnigoj in Bolčina na ta način gradbeno družbo Primorje oškodovala za približno 1,4 milijona evrov ter s tem družbi MGT Kumrovec omogočila protipravno premoženjsko korist za 1,1 milijona evrov. Ker pa v postopku na sodišču v Kopru ni bilo potrjeno, da bi pri sklenitvi posla ravnali neskrbno, so bili leta 2023 oproščeni.

Tožilstvo se je na oprostilno sodbo pritožilo, senat višjih sodnikov pa je po poročanju Primorskih novic pritožbo zavrnil kot neutemeljeno. Po pravnomočnosti sodbe lahko tožilstvo na vrhovno sodišče vloži še zahtevo za varstvo zakonitosti.

Med drugim leta 2012 obsojen v zadevi "čista lopata"

Črnigoju, ki se je po propadu Primorja upokojil, so sicer sodili zaradi očitkov o različnih kaznivih dejanjih. Skupaj s sedmerico soobtoženih je bil leta 2012 obsojen zaradi dajanja in terjanja nagrade v t. i. zadevi "čista lopata". Po pritožbi na višjem sodišču mu je bila izrečena 14-mesečna zaporna kazen, po dobrem letu prestajanja zaporne kazni pa je bil na prostost predčasno izpuščen julija 2014.

Leta 2018 je bil zaradi preslepitve pri pridobitvi posojila obsojen tudi na 28 mesecev zapora, a je kazen lahko odslužil s 480 urami družbenokoristnega dela. V zadevi Stavbenik pa je bil leta 2017 v ponovnem sojenju oproščen obtožb zlorabe položaja pri prodaji delnic.