Zaradi zapletov pri imenovanju je namreč začela delati tri tedne pozneje, kot bi sicer, težave pa so se vrstile bolj ali manj vse leto. EU se je po dvojni zavrnitvi ustavne pogodbe v Franciji in na Nizozemskem spomladi znašel v resni krizi, ki jo je še poglobil junijski propad pogajanj o prihodnji finančni perspektivi.

Komisiji se očita, da je šibka, saj Barroso že ob imenovanju ni imel podpore Francije in Nemčije, nekateri komisarji pa niti doma nimajo politične veljave.

Komisija grešni kozel
Evropska komisija je tarča postala tudi po dvojni zavrnitvi ustavne pogodbe, čeprav za te neuspehe, kamor lahko štejemo tudi junijski neslavni propad pogajanj o finančni perspektivi, ne nosi neposredne odgovornosti.

Neenotnost ekipe
Po napornem letu si tako nekdanji portugalski premier prizadeva predvsem utrditi oblast. Ekipa komisarjev včasih deluje precej neenotno, saj se je irski komisar za notranji trg McCreewy s kolegi javno spopadel, ko je šlo za vprašanje odpiranja evropskega trga storitev.

Barroso je bil izbran tudi zaradi znanja tujih jezikov in spretnega nastopa v javnosti, vendar so ga že kmalu doletele tudi kritike na račun predlaganih gospodarskih reform. Najbolj zagrizene zagovornike evropskega povezovanja pa je nedavno razočaral z izjavo, da bo morala Unija brez evropske ustave delovati še nekaj prihodnjih let.