Informacijski sistem druge generacije (SIS II) je bil sicer načrtovan za oktober 2007, zaradi zamude pa so ministri napovedali preučitev portugalskega predloga za vzpostavitev sistema SIS I plus, ki predvideva kopiranje sistema SIS I za vse nove članice.

Portugalski predlog naj bi novinkam omogočil vstop v schengensko območje brez zamud ob kloniranju starega sistema, hkrati pa bi razvijali nov sistem SIS II. S tem bi se EU izognil zamudi pri širitvi schengenskega območja.

Slovenija, ki sta jo v Luksemburgu zastopala notranji minister Dragutin Mate in pravosodni minister Lovro Šturm, se zavzema za uveljavitev portugalskega predloga. Predlog podpirajo tudi Češka, Slovaška, Madžarska in Litva, Poljska pa je izrazila zaskrbljenost zaradi morbitnih negativnih posledic hkratnega izvajanja dveh projektov.

Mate pozitivno o sistemu SIS I plus
Slovenski minister Dragutin Mate je dejal, da je rešitev zamude oblikovanja schengenskega informacijskega sistema druge generacije z nadomestno vpeljavo sistema SIS I plus najbolj realistična. Dejal je še, da bodo dokončno odločitev o možnosti vstopa članic v sistem SIS I plus in o odpravi nadzora na notranjih mejah sprejeli na decembrskem zasedanju.

Do takrat morajo namreč EU in njene države članice oblikovati izvedljiv načrt za ukinitev nadzora notranjih meja med starimi in novimi članicami. Finsko predsedstvo je zagotovilo, da si bo prizadevalo za čimprejšnjo širitev schengenskega območja, in je v ta namen napovedalo polno sodelovanje z Evropsko komisijo. Komisija pa je države članice opozorila, da bodo lahko za vpeljavo sistema SIS II v Bruslju zaprosile za dodatna finančna sredstva, morebitna vpeljava sistema SIS I plus pa bo prepuščena državam samim.

Ministri tudi o vizumih
Ministri so se dotaknili tudi težav pri odpravi vizumov za državljane EU-ja, ki potujejo v ZDA in posredovanju podatkov o letalskih potnikih iz EU-ja v ZDA. Ker prihaja do zastojev pri dogovorih o odpravi vizumov za državljane Grčije in novih članic Unije, razen Slovenije, Evropska komisija predlaga uvedbo vizumov za ameriške diplomate. Washington vztraja, da evropske države, ki še niso vključene v program visa waiver, ne izpolnjujejo vseh postavljenih pogojev.