Projekt je vreden 744 milijonov tolarjev, nekaj sredstev bo prispevala tudi Evropska komisija. Projekt bo izveden v več fazah, najprej bodo uredili sladkovodno močvirje na bertoški Bonifiki, nato bodo odstranili sediment iz lagune in tam uredili plitvine. Nazadnje bodo uredili še območje pod ankaransko vpadnico.

Območje Škocjanskega zatoka je bilo najprej opredeljeno kot naravni rezervat, od leta 2004 je tudi vključeno v evropsko ekološko omrežje Natura 2000 kot edino degradirano območje v Sloveniji, ki je na poti k renaturaciji.