Centralno čistilno napravo so na Goriškem načrtovali že pred dvema desetletjema, zanjo pridobili tudi del potrebnih sredstev iz evropskih skladov. Ker do realizacije naložbe ni prišlo, sta morali pozneje novogoriška in šempetrsko-vrtojbenska občina ta denar vrniti. Zaradi investicije, ki je bila načrtovana v Vrtojbi in se z njo tamkajšnji prebivalci niso strinjali, je prišlo posredno tudi do ustanovitve nove občine Šempeter - Vrtojba.

Zdaj pa so se občini Šempeter - Vrtojba in Miren - Kostanjevica ter mestna občina Nova Gorica dogovorile za gradnjo skupne centralne čistilne naprave. Vrednost projekta bo presegla 45 milijonov evrov, veliko potrebnih sredstev naj bi pridobili iz kohezijskega sklada in državnega proračuna, preostalo bodo prispevale občine.

Ob napravi bo zgrajena še nova kanalizacija
Čistilna naprava bo stala na istem mestu v Vrtojbi, kot je bila sprva predvidena. Predvidoma jo bodo začeli graditi leta 2012 in jo dokončali 2015, poskusno pa naj bi začela delovati leta 2013. Treba bo zgraditi tudi nove kanalizacijske vode. Skupna dolžina kanalizacije, ki bo vključena v naložbo, bo kar 15.686 metrov.

Vlagatelji načrtujejo, da bo centralna čistilna naprava ob Vrtojbici lahko očistila kar 41.000 enot. Odpadne vode naj bi bile očiščene tako dobro, da jih bo po čiščenju mogoče spustiti naravnost v vodotoke. Prav tako naj čistilne naprave kljub legi na poplavnemu območju med reko Vipavo in potokom Vrtojbico ne bi poplavljalo, ker bo povzdignjena na poseben plato.