Direktor inštituta Christian Pfeiffer je predtem Cerkev obtožil cenzure.

Jabolko spora med Cerkvijo in inštitutom je bila objava internih cerkvenih dokumentov. To naj bi Cerkev ovirala. Skupina s Pfeifferjem na čelu je preiskavo zlorab, ki med drugim zajema analizo dokumentov iz cerkvenih arhivov, prevzela leta 2011, nemška škofovska konferenca pa jo želi zdaj nadaljevati, vendar z novim partnerjem. Tudi skupina Pfeifferja je zatrdila, da bo nadaljevala delo, četudi brez podpore duhovščine.

"Zaupanje med direktorjem inštituta in nemškimi škofi je porušeno. Zaupanje pa je pri tako obširni in kočljivi preiskavi izredno pomembno," je dejal škof iz Trierja Stephan Ackermann, ki je v nemški Cerkvi pristojen za spolne zlorabe.

Znanstvena analiza preiskave
Predstavniki žrtev cerkvenih zlorab in kritični laiki so prekinitev sodelovanja označili za slab znak. Tudi nemška pravosodna ministrica Sabine Leutheusser-Schnarrenberger, ki prihaja iz vrst liberalcev (FDP), je kritično pripomnila, da bi morale biti preiskave več desetletij trajajočih spolnih zlorab otrok in mladostnikov v ustanovah Katoliške cerkve izvedene že zdavnaj. Od Cerkve je zahtevala obrazložitev prekinitve sodelovanja z inštitutom in obtožb o cenzuri in oviranju dela preiskovalcev.

Katoliška cerkev se je s preiskavo odzvala na škandale o spolnih zlorabah, ki so jo pretresli leta 2010. Spolne zlorabe župnikov in drugih pripadnikov duhovščine, predvsem med letoma 1950 in 1980, naj bi s preiskavo znanstveno analizirali, s tem pa preprečili prihodnje zlorabe in vrnili zaupanje v Cerkev. Preiskava naj bi trajala do leta 2014 in med drugim zajela pregled več sto tisoč datotek.

Zastopniki žrtev so preiskavo zlorab zahtevali tudi v nemškem bundestagu. "Katoliška cerkev je očitno s preiskavo preveč obremenjena," so razložili pri združenju žrtev cerkvenih zlorab Eckiger Tisch. Zdaj bo morebiti po zgledu Nizozemske bundestag imenoval posebno komisijo, ki bo preiskala zlorabe.