Programska oprema, ki je uporabljajo sedaj, je zastarela in neustrezna. Agencija tako uporablja le približno desetino programa. Prenova programa Virtual Case File je le eden od poskusov reorganizacije FBI-ja po terorističnih napadih 11. septembra.

Raziskave so namreč pokazale, da so bile ob napadih FBI in podobne agencije neuspešne, saj niso posredovale informacij, ki bi mogoče lahko preprečile napade. FBI tovrstnih problemov ni pričakoval.